精灵分布遵循特定生态规律，不同栖息地会出现不同类型的精灵。常磐森林作为早期区域，主要分布绿毛虫、独角虫等虫系精灵，以及波波这类常见飞行系。水系精灵如蚊香蝌蚪、角金鱼集中在河流或海域，需使用钓竿捕获。稀有精灵如皮卡丘在常磐森林有低概率出现，而神兽级精灵如火焰鸟、急冻鸟和闪电鸟分别位于灯火山顶、双子岛和无人发电厂，需完成特定条件才能触发遭遇。
华蓝市周边草地是小火龙的主要栖息地，初始精灵杰尼龟则需在真新镇上方草丛概率遇敌。岩石系精灵如小拳石多出现在月见山或岩山隧道，毒系阿柏怪常分布于冠军之路等后期区域。部分精灵如卡比兽会阻挡道路，需通过笛子唤醒后才能捕捉。而超梦作为隐藏精灵，需通关后进入华蓝洞窟最深处，其等级和强度远超常规精灵。
精灵进化形态通常不会在野外直接出现，但部分区域存在例外。例如大嘴雀作为波波的最终进化型，可在冠军之路遭遇；暴鲤龙虽为鲤鱼王进化形态，但个别水域能用高级钓竿直接钓获。野生原野区是特殊分布点，可同时捕获地面系、普通系和水系精灵，包括袋龙、嘟嘟等稀有物种，但需注意步数限制和捕捉规则。
精灵属性与地形强相关，火山区集中出现火系精灵，冰系精灵则局限于双子岛等寒冷环境。幽灵塔内仅有幽灵系精灵，而超能系多出没于城市建筑或特殊洞穴。游戏后期通过冲浪术可抵达七岛区域，此处分布着红蓝水督等特殊精灵，部分需通过事件触发。所有传说精灵均为单次遭遇，击败或逃跑后无法重新捕捉。
图鉴收集进度将影响部分稀有精灵的出现概率，而隐藏区域往往需要技能机或剧情道具解锁。掌握这些分布规律可显著提升收集效率，但需注意野外遭遇的随机性及等级差异对捕捉成功率的影响。
